RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CCDC172P0C7W6 258 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CALM1P0DP23 149 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CALM2P0DP24 149 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CALM3P0DP25 149 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 GRIN1Q05586 938 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TCP10Q12799 353 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SNED1Q8TER0 1413 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 WNT7AO00755 349 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.59■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 FAM196BA6NMK8 535 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 FOXN1O15353 648 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ZNF18P17022 549 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 BMP6P22004 513 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PODNQ7Z5L7 613 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 DGKHQ86XP1 1220 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CEP95Q96GE4 821 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PANX2Q96RD6 677 aa15.58■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 A0A0U1RQJ8 604 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 ERLIN2O94905 339 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CTAGE8P0CG41 777 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 SHC4Q6S5L8 630 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 KAT2BQ92831 832 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CNKSR1Q969H4 720 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 TEKT1Q969V4 418 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CEP83Q9Y592 693 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CTAGE9A4FU28 777 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CRKP46108 304 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 PPP2R5BQ15173 497 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 WDR93Q6P2C0 686 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.58■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 PRR29P0C7W0 189 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 NPY5RQ15761 445 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 DACT2Q5SW24 774 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 CYTH3O43739 400 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 BAG6P46379 1132 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.57■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 SCN9AQ15858 1988 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 NR1I3Q14994 352 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 PPP6R2O75170 966 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 SCG2P13521 617 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 AKR1B1P15121 316 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 MAP2K2P36507 400 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 DONSONQ9NYP3 566 aa15.56■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 YDJCA8MPS7 323 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 PPIP5K2O43314 1243 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB7AO95365 584 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 LONRF3Q496Y0 759 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 XBP1P17861 261 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 KIF5BP33176 963 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 KRT2P35908 639 aa15.55■□□□□ 0.08
GPC1-208ENST00000469694 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms