RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 LY9Q9HBG7 655 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SENP2Q9HC62 589 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 VAT1LQ9HCJ6 419 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP39A1Q9NYL5 469 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 MAD2L2Q9UI95 211 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC69A6NI79 296 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ASB14A6NK59 587 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 DDAH1O94760 285 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CNTN2Q02246 1040 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 TROAPQ12815 778 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 TSGA10IPQ3SY00 556 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO11Q86XK2 927 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K14Q99558 947 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 JMJD4Q9H9V9 463 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCB11O95342 1321 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC37A2A6NM11 1700 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NFIBO00712 420 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 AKR1A1P14550 325 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF5BP33176 963 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 LIFRP42702 1097 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 QRICH1Q2TAL8 776 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ARMCX2Q7L311 632 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ARRDC4Q8NCT1 418 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 FGD4Q96M96 766 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CALM1P0DP23 149 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CALM2P0DP24 149 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CALM3P0DP25 149 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 RARBP10826 455 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAF1Q13077 416 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ANO1Q5XXA6 986 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 RASEFQ8IZ41 740 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 DPF3Q92784 378 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 MAF1Q9H063 256 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SOWAHBA6NEL2 793 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB5O15062 677 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CALML3P27482 149 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HSPA4P34932 840 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 GNAQP50148 359 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ACVR2BQ13705 512 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MCF2L2Q86YR7 1114 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 RGS22Q8NE09 1264 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 AMNQ9BXJ7 453 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM184BQ9ULE4 1060 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 KBTBD13C9JR72 458 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 DNM1LO00429 736 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ADCK5Q3MIX3 580 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SGMS1Q86VZ5 419 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HOMER1Q86YM7 354 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR8Q96EF0 704 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 LZTS2Q9BRK4 669 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MYL10Q9BUA6 226 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 B4DLN1 442 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 FGD1P98174 961 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNB2Q92953 911 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 EVI5O60447 810 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMA5P28066 241 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SMARCA1P28370 1054 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms