RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466073.5

TFAP2A-208, Transcript of transcription factor AP-2 alpha, human

TSL 1 (best)

Gene TFAP2A, Length 987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFAP2A-208	ENST00000466073	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	SNAP25	P60880	206 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	HAND2	P61296	217 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	TNFAIP2	Q03169	654 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	NSMF	Q6X4W1	530 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	TLK2	Q86UE8	772 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	PNMA2	Q9UL42	364 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	ITGB8	P26012	769 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	NT5C2	P49902	561 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAAP100	Q0VG06	881 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	TBX21	Q9UL17	535 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TFAP2A-208	ENST00000466073	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	PDHB	P11177	359 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	SLC16A2	P36021	539 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	NKX3-2	P78367	333 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAM161B	Q96MY7	647 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	GUCD1	Q96NT3	240 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	VTA1	Q9NP79	307 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ASTN1	O14525	1302 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ARVCF	O00192	962 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZEB2	O60315	1214 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CABYR	O75952	493 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	SDS	P20132	328 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ESR2	Q92731	530 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	TTC14	Q96N46	770 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	NEDD4	P46934	1319 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	HIP1	O00291	1037 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CTAGE5	O15320	804 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	TIMP1	P01033	207 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	NUCB1	Q02818	461 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	NFIB	O00712	420 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CDK7	P50613	346 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	EPHB4	P54760	987 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	BEX3	Q00994	111 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF543	Q08ER8	600 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	MORC4	Q8TE76	937 aa		18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF213	O14771	459 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	SNHG28	P0DPA3	235 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	SMPD1	P17405	629 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	MFSD5	Q6N075	450 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	IQCA1	Q86XH1	822 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073		Q9Y3F1	56 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	TMEM199	Q8N511	208 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
TFAP2A-208	ENST00000466073	DLL1	O00548	723 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	CALML3	P27482	149 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	DGKH	Q86XP1	1220 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TFAP2A-208	ENST00000466073	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49

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