RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 M0R2N6 131 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 N4BP3O15049 544 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FOXN1O15353 648 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PRDM1O75626 825 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PRDX5P30044 214 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NOVP48745 357 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GRIN1Q05586 938 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RABGGTAQ92696 567 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 DISC1Q9NRI5 854 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 INTS13Q9NVM9 706 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 BCS1LQ9Y276 419 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TMEM232C9JQI7 657 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MFAP3LO75121 409 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RHOBTB3O94955 611 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KCNA3P22001 575 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MCM7P33993 719 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 DNM2P50570 870 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GNG11P61952 73 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 DMTNQ08495 405 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PDIA5Q14554 519 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SEPT2Q15019 361 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 USP49Q70CQ1 688 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SP8Q8IXZ3 490 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ADSSL1Q8N142 457 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TSC1Q92574 1164 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 STK17AQ9UEE5 414 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ABCB11O95342 1321 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KLRF2D3W0D1 207 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SNPHO15079 494 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 USP17L8P0C7I0 530 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MCM3P25205 808 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KRT83P78385 493 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RBL2Q08999 1139 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PSMD2Q13200 908 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 BRD3Q15059 726 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FIGNQ5HY92 759 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TAF3Q5VWG9 929 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NELFBQ8WX92 580 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA1Q92805 767 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CALML4Q96GE6 196 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GBP3Q9H0R5 595 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SWAP70Q9UH65 585 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GGA1Q9UJY5 639 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 STK24Q9Y6E0 443 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SNED1Q8TER0 1413 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GAKO14976 1311 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 A0A087X0B3 334 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CTAGE9A4FU28 777 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ18B7U540 433 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 STXBP3O00186 592 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ERLIN1O75477 346 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TADA3O75528 432 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 OR52Z1P0C646 297 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RASA1P20936 1047 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CDK8P49336 464 aa9.55□□□□□ -0.88
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