RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP100Q494V2 611 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KANK3Q6NY19 840 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TTLL6Q8N841 843 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 CNNM3Q8NE01 707 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PAGE5Q96GU1 130 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GMCL1Q96IK5 515 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MBOAT7Q96N66 472 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR9Q96QG7 549 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FAM196BA6NMK8 535 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 STK25O00506 426 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PPIP5K2O43314 1243 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SLC34A2O95436 690 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ATP1A3P13637 1013 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TERF1P54274 439 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCZ1BP86790 482 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA3FQ13275 785 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 INF2Q27J81 1249 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DCAF4Q8WV16 495 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GSDMAQ96QA5 445 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SBF1O95248 1867 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK1Q14185 1865 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PRG0 241 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SMCO2A6NFE2 343 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SMTNL1A8MU46 457 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NFKBIEO00221 500 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD14O00487 310 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 OPLAHO14841 1288 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB5O15062 677 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KLRC4O43908 158 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D12O60347 775 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 PBX1P40424 430 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ6P48051 423 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PRELPP51888 382 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NAPAP54920 295 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TGFB2P61812 414 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LRMPQ12912 555 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SEPT2Q15019 361 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NEK8Q86SG6 692 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FAM83AQ86UY5 434 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.41□□□□□ -1.38
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