RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 CD3EP07766 207 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PI3P19957 117 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 GIPRP48546 466 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 GNPTABQ3T906 1256 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 TMC6Q7Z403 805 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 JAMLQ86YT9 394 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 OR6P1Q8NGX9 317 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 HAUS7Q99871 368 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 CDR1P51861 262 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 POU4F1Q01851 419 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 MVKQ03426 396 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A087WZG4 1122 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PQH9 124 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 INHBBP09529 407 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 MSL3P1P0C860 447 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 IFNGR1P15260 489 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 GJA8P48165 433 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP2R5DQ14738 602 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 WHRNQ9P202 907 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 RPTNQ6XPR3 784 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PANK1Q8TE04 598 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 MZB1Q8WU39 189 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC7A5Q01650 507 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 GBP3Q9H0R5 595 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 LILRA6Q6PI73 481 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 LDHDQ86WU2 507 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 SHDQ96IW2 340 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D8O95759 1140 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 EPHX1P07099 455 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 NR1I3Q14994 352 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP2R5EQ16537 467 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 FGD4Q96M96 766 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PQJ5 194 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 BMP7P18075 431 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PPM1BO75688 479 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 DBHP09172 617 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPKAPK2P49137 400 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CORO7P57737 925 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 BICRALQ6AI39 1079 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 STXBP3O00186 592 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 AURKAO14965 403 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 SRGAP3O43295 1099 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 VAMP4O75379 141 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CYBBP04839 570 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 TACR1P25103 407 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 L1CAMP32004 1257 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 NCKAP1LP55160 1127 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM13O60858 407 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXA5P20719 270 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CASP7P55210 303 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM129CQ86XR2 697 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms