RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 EXOC1Q9NV70 894 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 ATP2B4P23634 1241 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 H7C1D1 291 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 TDP2O95551 362 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 SLC16A2P36021 539 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 UBE2SQ16763 222 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 MB21D1Q8N884 522 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 TNNI2P48788 182 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 POTEMA6NI47 508 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 RGL2O15211 777 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 GNA11P29992 359 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 SBF2Q86WG5 1849 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 SLC37A4O43826 429 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 CHMP4BP1P59074 171 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 DDR1Q08345 913 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 GOLGA1Q92805 767 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 TRIM9Q9C026 710 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 ENC1O14682 589 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 IL1R1P14778 569 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 CTAGE9A4FU28 777 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 FAM196BA6NMK8 535 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 PDHBP11177 359 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 MCM6Q14566 821 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS3-202ENST00000460120 ERICH4A6NGS2 130 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SASH3O75995 380 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 RHOBTB3O94955 611 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 IDEP14735 1019 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PLA2G4AP47712 749 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CACNB3P54284 484 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 GALNT17Q6IS24 598 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 LGALS16A8MUM7 142 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TTI2Q6NXR4 508 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CALCRLQ16602 461 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CCDC96Q2M329 555 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 KCTD1Q719H9 257 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CCDC51Q96ER9 411 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PLCG2P16885 1265 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ARHGAP25P42331 645 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CRY2Q49AN0 593 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 MYH8P13535 1937 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 P2RX5Q93086 422 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CALML4Q96GE6 196 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NDUFA10O95299 355 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 KCNB1Q14721 858 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 LRRC41Q15345 812 aa20.3■□□□□ 0.84
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