RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 STAT3P40763 770 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 JADE2Q9NQC1 790 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CDC25BP30305 580 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SLFN13Q68D06 897 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 PHACTR2O75167 634 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP27A1Q02318 531 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB34Q9BZG1 259 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ICA1Q05084 483 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP6O43182 974 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 AKR1B10O60218 316 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 OGFOD1Q8N543 542 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR24Q96S15 920 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DISC1Q9NRI5 854 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 GRM4Q14833 912 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CSRNP1Q96S65 589 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DISP2A7MBM2 1401 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SFI1A8K8P3 1242 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CRKP46108 304 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DPYDQ12882 1025 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 KLK7P49862 253 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 AMPD3Q01432 767 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 GH2P01242 217 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SYCP1Q15431 976 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXL16Q8N461 479 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 RDH13Q8NBN7 331 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 GSDMAQ96QA5 445 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 IL17AQ16552 155 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 BARHL2Q9NY43 387 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 BCS1LQ9Y276 419 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 TTLL1O95922 423 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 TICAM2Q86XR7 235 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.022e-7■■■□□ 16.3
RABGEF1-210ENST00000437078 UTRNP46939 3433 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-210ENST00000437078 STXBP3O00186 592 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 ALDH1B1P30837 517 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMYND10O75800 440 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 E9PMD0 336 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 LONP1P36776 959 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 SPA17Q15506 151 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 CERS5Q8N5B7 392 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 ST7Q9NRC1 585 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 PDE6BP35913 854 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 FUT2Q10981 343 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 STK4Q13043 487 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-210ENST00000437078 CUL5Q93034 780 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms