RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MCM7P33993 719 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SIK1P57059 783 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPP2R5AQ15172 486 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NTRK3Q16288 839 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SCN7AQ01118 1682 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ATRNO75882 1429 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 A0A087X0B3 334 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 STAT6P42226 847 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MB21D1Q8N884 522 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KRT23Q9C075 422 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KLC4Q9NSK0 619 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.4□□□□□ -0.9
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.4□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 B4DLN1 442 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SEC24CP53992 1094 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DPYDQ12882 1025 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NAA25Q14CX7 972 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CNPY4Q8N129 248 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYH3P11055 1940 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 H7C1D1 291 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 H7C1W4 665 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SCP2P22307 547 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HERVK_113P62684 666 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PTGDRQ13258 359 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TTC38Q5R3I4 469 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ALS2CLQ60I27 953 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FERMT2Q96AC1 680 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PSMA7O14818 248 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FOXP2O15409 715 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MBD4O95243 580 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MOCS3O95396 460 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BMP15O95972 392 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HLFQ16534 295 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IFT20Q8IY31 132 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRIM58Q8NG06 486 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RUBCNQ92622 972 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARMT1Q9H993 441 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EHD2Q9NZN4 543 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ESYT3A0FGR9 886 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NR1D1P20393 614 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ELF1P32519 619 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NLRP5P59047 1200 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GUCY2DQ02846 1103 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SYNE4Q8N205 404 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CEP120Q8N960 986 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FANCBQ8NB91 859 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZIM3Q96PE6 472 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 STIM2Q9P246 746 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NFU1Q9UMS0 254 aa9.39□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADD2P35612 726 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRCPP42785 496 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 APBA1Q02410 837 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EMBQ6PCB8 327 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IQCA1Q86XH1 822 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM89AQ96GI7 184 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GGA2Q9UJY4 613 aa9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LSP1P33241 339 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms