RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMOD1	P28289	359 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MXRA7	P84157	204 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL15A1	P39059	1388 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STIM2	Q9P246	746 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP21	Q9UK80	565 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AFF2	P51816	1311 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	N4BP3	O15049	544 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM37	O94972	964 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUB	P50607	506 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MORC3	Q14149	939 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD302	Q8IX05	232 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EVI5	O60447	810 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALAD	P13716	330 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STX17	P56962	302 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DBN1	Q16643	649 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAFG	O15525	162 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IDE	P14735	1019 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCND1	P24385	295 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT9	P35527	623 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD151	P48509	253 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HERVK_113	P62684	666 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RUBCN	Q92622	972 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.58	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658		M0R2C6	588 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF5B	P33176	963 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POSTN	Q15063	836 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LGR5	O75473	907 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHGB	P05060	677 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNGA1	P29973	690 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms