RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427271.1

TTF2-202, Transcript of transcription termination factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene TTF2, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2-202ENST00000427271 ST5P78524 1137 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 CLCQ05315 142 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 KRT24Q2M2I5 525 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PROSER3Q2NL68 480 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TNNI3KQ59H18 835 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 SLC51AQ86UW1 340 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 NGEFQ8N5V2 710 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TTLL6Q8N841 843 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ACDQ96AP0 544 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 KRT82Q9NSB4 513 aa6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 SNED1Q8TER0 1413 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ERBB4Q15303 1308 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 COL4A1P02462 1669 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 COL4A5P29400 1685 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 H0YIN7 160 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 FSCN2O14926 492 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 NPHP1O15259 732 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 LILRB5O75023 590 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ATE1O95260 518 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 GPTP24298 496 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 KRT76Q01546 638 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 GK5Q6ZS86 529 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 KCNB2Q92953 911 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PCNTO95613 3336 aa6.85□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 M0R082 166 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TM4SF5O14894 197 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ECEL1O95672 775 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 SRGNP10124 158 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PDE6BP35913 854 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 POU4F3Q15319 338 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 CCDC184Q52MB2 194 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 CHSY3Q70JA7 882 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 RUNDC1Q96C34 613 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 CRBNQ96SW2 442 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 CORO1BQ9BR76 489 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.84□□□□□ -1.31
TTF2-202ENST00000427271 TAF1P21675 1872 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 GFRA2O00451 464 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 NTSR2O95665 410 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 MAOBP27338 520 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 CDK8P49336 464 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 SDE2Q6IQ49 451 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 STYK1Q6J9G0 422 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 OLFM4Q6UX06 510 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.82□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 OIP5O43482 229 aa6.82□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 ZNF862O60290 1169 aa6.82□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 CTSBP07858 339 aa6.82□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 RASA3Q14644 834 aa6.82□□□□□ -1.32
TTF2-202ENST00000427271 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms