RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.032e-8■■■□□ 16.1
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USP39-202ENST00000409025 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.47■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 AK8Q96MA6 479 aa21.47■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 GOPCQ9HD26 462 aa21.47■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.47■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 TMX2Q9Y320 296 aa21.47■■□□□ 1.03
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USP39-202ENST00000409025 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.47■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 ECE1P42892 770 aa21.46■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 DPYDQ12882 1025 aa21.46■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.46■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 AMNQ9BXJ7 453 aa21.46■■□□□ 1.03
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USP39-202ENST00000409025 CDC25AP30304 524 aa21.45■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 CAP2P40123 477 aa21.45■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 STAT6P42226 847 aa21.45■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 MAP3K10Q02779 954 aa21.45■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 GSDMAQ96QA5 445 aa21.45■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 DISC1Q9NRI5 854 aa21.45■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 FZD9O00144 591 aa21.45■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 ACER1Q8TDN7 264 aa21.45■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 SH2D4AQ9H788 454 aa21.45■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 CALCRLQ16602 461 aa21.44■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.44■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 FBXO11Q86XK2 927 aa21.44■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 POTEDQ86YR6 584 aa21.44■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 MICALL2Q8IY33 904 aa21.44■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 PP2D1A8MPX8 630 aa21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 STAT2P52630 851 aa21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 TDP2O95551 362 aa21.42■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 CASP1P29466 404 aa21.42■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USP17L11C9JVI0 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USP17L18D6R9N7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USP17L22D6RA61 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USP17L19D6RCP7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USP17L20D6RJB6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 USP17L24Q0WX57 530 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 TRAF1Q13077 416 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 AP3B2Q13367 1082 aa21.41■■□□□ 1.02
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USP39-202ENST00000409025 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.41■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 USH1GQ495M9 461 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 TEPSINQ96N21 525 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 MTRQ99707 1265 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 RAB34Q9BZG1 259 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 CUEDC2Q9H467 287 aa21.4■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 PTGS1P23219 599 aa21.39■■□□□ 1.02
USP39-202ENST00000409025 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
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