RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404125.5

PSME4-202, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME4, Length 7,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-202ENST00000404125 BNIP3LO60238 219 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 GRAPQ13588 217 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 IGKV5-2P06315 115 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CFAP58Q5T655 872 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CAVIN2O95810 425 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CD58P19256 250 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 KCTD2Q14681 263 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.1■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CAPN9O14815 690 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 NBPF3Q9H094 633 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 IFNB1P01574 187 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ABCC3O15438 1527 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ADCY1Q08828 1119 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ODR4Q5SWX8 454 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 COL15A1P39059 1388 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 EVCP57679 992 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 NPR1P16066 1061 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 ZNF75DP51815 510 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 SCARF1Q14162 830 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 TBC1D8O95759 1140 aa15.08■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.08■□□□□ 0.01
PSME4-202ENST00000404125 MASTLQ96GX5 879 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ABCB11O95342 1321 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 CXCR5P32302 372 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 NUMBP49757 651 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 MTMR6Q9Y217 621 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 BMP3P12645 472 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 EPSTI1Q96J88 318 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L15C9J2P7 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L11C9JVI0 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L18D6R9N7 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L22D6RA61 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L19D6RCP7 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L20D6RJB6 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 OSBPP22059 807 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L24Q0WX57 530 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 TXNRD1Q16881 649 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.08■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 CRCPO75575 148 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 SNX1Q13596 522 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 SEPT2Q15019 361 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 BIRC2Q13490 618 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ZNF394Q53GI3 561 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ALKQ9UM73 1620 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 APOA5Q6Q788 366 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 CNGA4Q8IV77 575 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ENC1O14682 589 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 VIMP08670 466 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 KRT81Q14533 505 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 CEP170P1Q96L14 293 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 DYNLT1P63172 113 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ELF2Q15723 593 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 ADAM9Q13443 819 aa15.07■□□□□ 0
PSME4-202ENST00000404125 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms