RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393243.5

GSE1-202, Transcript of Gse1 coiled-coil protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GSE1, Length 7,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSE1-202ENST00000393243 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 ZBBXA8MT70 800 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 BAG5Q9UL15 447 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 SLCO1A2P46721 670 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 ADAM9Q13443 819 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 LRRC41Q15345 812 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 LRRN2O75325 713 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PALD1Q9ULE6 856 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PPFIA4O75335 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 BTBD18B2RXH4 712 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 APOEP02649 317 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 ARHGAP4P98171 946 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 GCKRQ14397 625 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 GNA14O95837 355 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 GPT2Q8TD30 523 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 ADALQ6DHV7 355 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 CROCCP2Q86T23 111 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 STK32BQ9NY57 414 aa14.65□□□□□ -0.06
GSE1-202ENST00000393243 CLIC2O15247 247 aa14.65□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 KCNQ3O43525 872 aa14.65□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 STMN1P16949 149 aa14.65□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 TMED2Q15363 201 aa14.65□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.65□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.65□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 GNGT2O14610 69 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 PTGDRQ13258 359 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 NIM1KQ8IY84 436 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 TCP11Q8WWU5 503 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SLC35F6Q8N357 371 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 CASP14P31944 242 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 PARP10Q53GL7 1025 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 PDE1BQ01064 536 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SNCBQ16143 134 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.64□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 MEIS1O00470 390 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 INHBAP08476 426 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SLC7A5Q01650 507 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SULF1Q8IWU6 871 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 CFAP36Q96G28 342 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 A6NJR5 290 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 KLRF2D3W0D1 207 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ARPP19P56211 112 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 TRIM4Q9C037 500 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 CCNYQ8ND76 341 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 STK24Q9Y6E0 443 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 MAST3O60307 1309 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 A6NNZ2 444 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.63□□□□□ -0.07
GSE1-202ENST00000393243 OSTNP61366 133 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms