RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379655.8

KIFC3-201, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene KIFC3, Length 3,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-201ENST00000379655 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 CDC23Q9UJX2 597 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 BMP15O95972 392 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 PANX2Q96RD6 677 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.53■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 H3BQF6 201 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 NDUFA10O95299 355 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 BUB1O43683 1085 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 NYXQ9GZU5 481 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 SPEF2Q9C093 1822 aa20.52■□□□□ 0.88
KIFC3-201ENST00000379655 RASA1P20936 1047 aa20.52■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.873e-6■■■□□ 18
KIFC3-201ENST00000379655 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.52■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MB21D1Q8N884 522 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 RMND1Q9NWS8 449 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 NARFQ9UHQ1 456 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 SPATA20Q8TB22 786 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 C4AP0C0L4 1744 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 C4BP0C0L5 1744 aa20.51■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 OR52Z1P0C646 297 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 SLC7A5Q01650 507 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MYO6Q9UM54 1294 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 RCCD1A6NED2 376 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 AKR1B10O60218 316 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 STXBP3O00186 592 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 ORC4O43929 436 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 PPP2R5BQ15173 497 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 RRAGAQ7L523 313 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.5■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 KIF20AO95235 890 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 C2orf54Q08AI8 447 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CCDC42Q96M95 316 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MMS19Q96T76 1030 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 NCK2O43639 380 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CALML4Q96GE6 196 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 C6orf50Q9HD87 102 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.871e-18■■■■■ 447.2
KIFC3-201ENST00000379655 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.49■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L15C9J2P7 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L11C9JVI0 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L18D6R9N7 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L22D6RA61 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L19D6RCP7 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L20D6RJB6 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 SLC37A4O43826 429 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L24Q0WX57 530 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USH1GQ495M9 461 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MSL1Q68DK7 614 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 ADSSL1Q8N142 457 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MYH8P13535 1937 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 MEIS1O00470 390 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 RABGGTAQ92696 567 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 CD209Q9NNX6 404 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.48■□□□□ 0.87
KIFC3-201ENST00000379655 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms