RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 PKN1Q16512 942 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 MB21D1Q8N884 522 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF536O15090 1300 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 BTBD7Q9P203 1132 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 PEX10O60683 326 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 MBD3O95983 291 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 BRAPQ7Z569 592 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CPXCR1Q8N123 301 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 SPATA32Q96LK8 384 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CNMDO75829 334 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ICAM1P05362 532 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CRHR2Q13324 411 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CFAP45Q9UL16 551 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CA12O43570 354 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 MMP1P03956 469 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 SCG2P13521 617 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 OAZ1P54368 228 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXO11Q86XK2 927 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP2A1O14983 1001 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 TLR2O60603 784 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 UBE2HP62256 183 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 PLS1Q14651 629 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 GSE1Q14687 1217 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 USH1GQ495M9 461 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ATL3Q6DD88 541 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 USP28Q96RU2 1077 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 AMNQ9BXJ7 453 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 ELP1O95163 1332 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-204ENST00000373436 XBP1P17861 261 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 STAT3P40763 770 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 ERVK-9P63128 1117 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 ERVK-24P63145 666 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 Q3C1V9 767 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 COA7Q96BR5 231 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 SHISA4Q96DD7 197 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 RNF186Q9NXI6 227 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 CPA4Q9UI42 421 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 BARHL2Q9NY43 387 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 TRPA1O75762 1119 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 BCRP11274 1271 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 PNMA2Q9UL42 364 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 RIPK3Q9Y572 518 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 BTBD18B2RXH4 712 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 STXBP3O00186 592 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 C17orf99Q6UX52 265 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D8O95759 1140 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 ALAS1P13196 640 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 TRAF1Q13077 416 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms