RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 TLR3O15455 904 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PPP4R4-202ENST00000328839 ORC4O43929 436 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4R4-202ENST00000328839 CDK7P50613 346 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4R4-202ENST00000328839 EEPD1Q7L9B9 569 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4R4-202ENST00000328839 TLK2Q86UE8 772 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4R4-202ENST00000328839 DCAF4Q8WV16 495 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A0D9SFI3 127 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 ALX1Q15699 326 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 MFSD5Q6N075 450 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 ASTN1O14525 1302 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 CTAGE5O15320 804 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC16A2P36021 539 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 AP5M1Q9H0R1 490 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 FGAP02671 866 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 ICAM1P05362 532 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 FOSL2P15408 326 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.321e-6■■□□□ 13.3
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PPP4R4-202ENST00000328839 FAM126BQ8IXS8 530 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 PDGFCQ9NRA1 345 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 EYSQ5T1H1 3165 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 PTGS1P23219 599 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 HAND2P61296 217 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM199Q8N511 208 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 FGRP09769 529 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 CSF2RAP15509 400 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 SMPD1P17405 629 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAJB2P25686 324 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 NOVP48745 357 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 ZEB2O60315 1214 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 NKX3-2P78367 333 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 RILPL2Q969X0 211 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 LNPKQ9C0E8 428 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 CDH23Q9H251 3354 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4R4-202ENST00000328839 CABYRO75952 493 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 IQSEC1Q6DN90 963 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 CUL9Q8IWT3 2517 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ACRP10323 421 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2C18P33260 490 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGA7Q13683 1181 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TAPT1Q6NXT6 567 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 BTNL9Q6UXG8 535 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 VTA1Q9NP79 307 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 NFIBO00712 420 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 CD4P01730 458 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM240Q5SV17 173 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 C16orf59Q7L2K0 433 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ZMYM6O95789 1325 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM63BQ5T3F8 832 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TIFAQ96CG3 184 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 PDHBP11177 359 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIN2CQ14957 1233 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF365Q70YC5 407 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 HIPK3Q9H422 1215 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 Q9Y3F1 56 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 CALML3P27482 149 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMC6P62333 389 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TICAM2Q86XR7 235 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC43A3Q8NBI5 491 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF576Q9H609 170 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 GRXCR1A8MXD5 290 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.45■■■□□ 2.31
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