RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 CABP7Q86V35 215 aa16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 NEDD9Q14511 834 aa16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 A0A087X0B3 334 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 PDE8BO95263 885 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 GNAT2P19087 354 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 SNCBQ16143 134 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
LRRN1-201ENST00000319331 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 LGALS16A8MUM7 142 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 KIF4AO95239 1232 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 DAAM2Q86T65 1068 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 LPIN2Q92539 896 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CYP27B1O15528 508 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 NMT2O60551 498 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ZBED6P86452 979 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 LLGL1Q15334 1064 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 GCKP35557 465 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 RPS6KA1Q15418 735 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 NBPF3Q9H094 633 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 SUFUQ9UMX1 484 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 UTYO14607 1347 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CIAO1O76071 339 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 HSPA2P54652 639 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ZIM3Q96PE6 472 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 PLAAQ9Y263 795 aa16.57■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 SCG2P13521 617 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 GYG1P46976 350 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 DPYDQ12882 1025 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 RASGRF1Q13972 1273 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 VPS36Q86VN1 386 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TSPY3P0CV98 308 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TSPY8P0CW00 308 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TNNI2P48788 182 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CHUKO15111 745 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CALM1P0DP23 149 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CALM2P0DP24 149 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CALM3P0DP25 149 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 UBE4AQ14139 1066 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 WDR93Q6P2C0 686 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 SV2BQ7L1I2 683 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 BLIDQ8IZY5 108 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.56■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CPDO75976 1380 aa16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 NEFHP12036 1026 aa16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CPVLQ9H3G5 476 aa16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CTSWP56202 376 aa16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 EMBQ6PCB8 327 aa16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
LRRN1-201ENST00000319331 TBC1D5Q92609 795 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms