RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 YY1AP1Q9H869 796 aa18.58■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 DACT1Q9NYF0 836 aa18.58■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.58■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa18.58■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 SOCS7O14512 581 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC174Q6PII3 467 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 MTMR8Q96EF0 704 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 YEATS4O95619 227 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 STAT2P52630 851 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PICK1Q9NRD5 415 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 MCM7P33993 719 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 C6orf50Q9HD87 102 aa18.57■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L15C9J2P7 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L11C9JVI0 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L18D6R9N7 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L22D6RA61 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L19D6RCP7 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L20D6RJB6 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L24Q0WX57 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 HS1BP3Q53T59 392 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 FSIP1Q8NA03 581 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.56■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TTC38Q5R3I4 469 aa18.55■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TULP2O00295 520 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 HMGCS2P54868 508 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ADALQ6DHV7 355 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CDCA5Q96FF9 252 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 SH2D4AQ9H788 454 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 RRAGCQ9HB90 399 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 DOCK1Q14185 1865 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TRAF5O00463 557 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 GNA11P29992 359 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ADCY7P51828 1080 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 VGLL4Q14135 290 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 10.2
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 NDUFA8P51970 172 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 HOOK2Q96ED9 719 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.54■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC66A2RUB6 948 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PTGDRQ13258 359 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO11Q86XK2 927 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 UIMC1Q96RL1 719 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 SHC4Q6S5L8 630 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TBC1D5Q92609 795 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.53■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 VCAM1P19320 739 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 LETM2Q2VYF4 491 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 USP49Q70CQ1 688 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 AMNQ9BXJ7 453 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 BACE1P56817 501 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF445P59923 1031 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 TBCKQ8TEA7 893 aa18.52■□□□□ 0.56
CHTF18-202ENST00000317063 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 CPXCR1Q8N123 301 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 WNK4Q96J92 1243 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ELP3Q9H9T3 547 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 MAP3K9P80192 1104 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 GALNT17Q6IS24 598 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138 ms