RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBED4O75132 1171 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 DSG3P32926 999 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ATG4CQ96DT6 458 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 MYPNQ86TC9 1320 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF536O15090 1300 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCB11O95342 1321 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2B1P20020 1258 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2HP62256 183 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TREML2Q5T2D2 321 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAK2O60296 914 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SNAPC2Q13487 334 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 CST9Q5W186 159 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTLC2O15270 562 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC39A14Q15043 492 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2SQ16763 222 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM260Q9NX78 707 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD3O95983 291 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 GJA5P36382 358 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ME1P48163 572 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 INF2Q27J81 1249 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC38Q5R3I4 469 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 CPXCR1Q8N123 301 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 WNK4Q96J92 1243 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPAQ15257 358 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 MCTP2Q6DN12 878 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 JMYQ8N9B5 988 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 OPLAHO14841 1288 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 BMP15O95972 392 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 OAZ1P54368 228 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 AP3B2Q13367 1082 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 MEIS2O14770 477 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF3CO14782 793 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PASKQ96RG2 1323 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3CDO00329 1044 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP6R2O75170 966 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 HUNKP57058 714 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 45.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MOGSQ13724 837 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 NEK8Q86SG6 692 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 GPT2Q8TD30 523 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TBCKQ8TEA7 893 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PGBD1Q96JS3 809 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2A2P52657 109 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 REPS2Q8NFH8 660 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 WNT7AO00755 349 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2A1O14983 1001 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ALAS1P13196 640 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF174Q15697 407 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CFBP00751 764 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR2MP0CAP2 368 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CETPP11597 493 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MCM7P33993 719 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 SPRYD7Q5W111 196 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MB21D1Q8N884 522 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ANO3Q9BYT9 981 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 LETM2Q2VYF4 491 aa23.61■■□□□ 1.37
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