RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ARL8AQ96BM9 186 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CACNA1FO60840 1977 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CEP104O60308 925 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 LLGL1Q15334 1064 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TECP42680 631 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TSG101Q99816 390 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 KIF1AQ12756 1690 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CASP7P55210 303 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 AMPD3Q01432 767 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 LRRC41Q15345 812 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 FAM212AQ96EL1 285 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 LGALS16A8MUM7 142 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SCG2P13521 617 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP25P42331 645 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CPVLQ9H3G5 476 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 JCADQ9P266 1359 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 EPHB4P54760 987 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PAK2Q13177 524 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CABP7Q86V35 215 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CEP89Q96ST8 783 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.97■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CALML3P27482 149 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 KIF11P52732 1056 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NUP58Q9BVL2 599 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 STIM2Q9P246 746 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NAA35Q5VZE5 725 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 XDHP47989 1333 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 WNT7AO00755 349 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 KCNK3O14649 394 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PDE8AO60658 829 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MSL1Q68DK7 614 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 BLIDQ8IZY5 108 aa16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.96■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 SLIT3O75094 1523 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 NR1D1P20393 614 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 BANK1Q8NDB2 785 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CCDC172P0C7W6 258 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CALM1P0DP23 149 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CALM2P0DP24 149 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CALM3P0DP25 149 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 HERVK_113P62684 666 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 ZBED6P86452 979 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 DPH5Q9H2P9 285 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 MYZAPP0CAP1 466 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 TSPY3P0CV98 308 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 TSPY8P0CW00 308 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 KRT71Q3SY84 523 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 WDR93Q6P2C0 686 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 ATG3Q9NT62 314 aa16.95■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 STK36Q9NRP7 1315 aa16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 FCER1AP12319 257 aa16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 SEMA3EO15041 775 aa16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CD248Q9HCU0 757 aa16.94■□□□□ 0.3
USP25-201ENST00000285679 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms