RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 CALM1P0DP23 149 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CALM2P0DP24 149 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CALM3P0DP25 149 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 KIF5BP33176 963 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 WDR59Q6PJI9 974 aa9.74□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 ADSSL1Q8N142 457 aa9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 PANX2Q96RD6 677 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MMS19Q96T76 1030 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 CD209Q9NNX6 404 aa9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 NID2Q14112 1375 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CTAGE9A4FU28 777 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 NCK2O43639 380 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TXLNAP40222 546 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MB21D1Q8N884 522 aa9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CCP110O43303 1012 aa9.72□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.72□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 FLT1P17948 1338 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L15C9J2P7 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L11C9JVI0 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L18D6R9N7 530 aa9.72□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L19D6RCP7 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L20D6RJB6 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 STAT3P40763 770 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L24Q0WX57 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.72□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 VPS18Q9P253 973 aa9.72□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 KIAA1328Q86T90 577 aa9.71□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CNGA4Q8IV77 575 aa9.71□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.71□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CDC23Q9UJX2 597 aa9.71□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 ZNF263O14978 683 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 MYBL2P10244 700 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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