RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SLC20A2Q08357 652 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 LMNB1P20700 586 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MCM7P33993 719 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 DISC1Q9NRI5 854 aa11.12□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 KLRC4O43908 158 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TSPY3P0CV98 308 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TSPY8P0CW00 308 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 CDK8P49336 464 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 PTPN21Q16825 1174 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 KIFC2Q96AC6 838 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 CCDC51Q96ER9 411 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RMND1Q9NWS8 449 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 FLT1P17948 1338 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 PLCG2P16885 1265 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 BTDP43251 543 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SBF1O95248 1867 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SIPA1L1O43166 1804 aa11.11□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ESYT2A0FGR8 921 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MAP3K9P80192 1104 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 DNAI1Q9UI46 699 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MYH4Q9Y623 1939 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 CLRN2A0PK11 232 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MFAP3LO75121 409 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 CRKP46108 304 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GABPAQ06546 454 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 PICALMQ13492 652 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ELF2Q15723 593 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 DLK2Q6UY11 383 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ADSSL1Q8N142 457 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 LRRC15Q8TF66 581 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 AK8Q96MA6 479 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 CUEDC2Q9H467 287 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 FZD9O00144 591 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RHOBTB3O94955 611 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GYPCP04921 128 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SNHG28P0DPA3 235 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SPAG1Q07617 926 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RBL2Q08999 1139 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 NFIAQ12857 509 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 PAK1Q13153 545 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 KRT31Q15323 416 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 KLRF2D3W0D1 207 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TADA3O75528 432 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TCP10Q12799 353 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-201ENST00000259467 GMLQ99445 158 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms