RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248899.10

NCF4-201, Transcript of neutrophil cytosolic factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCF4, Length 1,396 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4-201ENST00000248899 MCTP1Q6DN14 999 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 MTMR7Q9Y216 660 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 DNAH12Q6ZR08 3092 aa16.08■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CNMDO75829 334 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 NDUFB10O96000 172 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FOSBP53539 338 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PRMT2P55345 433 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CCDC96Q2M329 555 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GALNT17Q6IS24 598 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ZNF333Q96JL9 665 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 VCPKMTQ9H867 229 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CFAP45Q9UL16 551 aa16.07■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CEP290O15078 2479 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 BMP3P12645 472 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CALML3P27482 149 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FLT3LGP49771 235 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 RGS19P49795 217 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ERVK-9P63128 1117 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ERVK-24P63145 666 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 Q3C1V9 767 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PORCNQ9H237 461 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 BRMS1Q9HCU9 246 aa16.06■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 POTEFA5A3E0 1075 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PLA2G6O60733 806 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 HOXD10P28358 340 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 RAET1EQ8TD07 263 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 MTMR8Q96EF0 704 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 BARHL2Q9NY43 387 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 BTBD7Q9P203 1132 aa16.05■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ELP1O95163 1332 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ELNP15502 786 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 LBX2Q6XYB7 198 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 LPAR1Q92633 364 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.04■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GRK4P32298 578 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 KRT2P35908 639 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 MTFR1Q15390 333 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 KCTD1Q719H9 257 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 COA7Q96BR5 231 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 GJD2Q9UKL4 321 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.03■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ESYT2A0FGR8 921 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 KIF28PB7ZC32 967 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 STXBP3O00186 592 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 ZBTB5O15062 677 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 RAD21O60216 631 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 NLRP5P59047 1200 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 TRAF1Q13077 416 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 NBR1Q14596 966 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.02■□□□□ 0.16
NCF4-201ENST00000248899 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms