RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ADD2P35612 726 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 HSPA2P54652 639 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 NFAT5O94916 1531 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 GMNCA6NCL1 334 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CIAO1O76071 339 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PAK2Q13177 524 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SRGNP10124 158 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 MYH10P35580 1976 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ZBED6P86452 979 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.372e-6■■■□□ 14.7
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ODC1-201ENST00000234111 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.58■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 DNM2P50570 870 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 INHBEP58166 350 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TRADDQ15628 312 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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ODC1-201ENST00000234111 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.57■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TMEM94Q12767 1356 aa23.57■■□□□ 1.36
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ODC1-201ENST00000234111 XRCC4Q13426 336 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TCIRG1Q13488 830 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TRIM47Q96LD4 638 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 EXOC1Q9NV70 894 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TMOD1P28289 359 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.56■■□□□ 1.36
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ODC1-201ENST00000234111 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 RMND1Q9NWS8 449 aa23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
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ODC1-201ENST00000234111 PRDM1O75626 825 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 GCKP35557 465 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.55■■□□□ 1.36
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ODC1-201ENST00000234111 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TLR10Q9BXR5 811 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ZPR1O75312 459 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 KRT2P35908 639 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 NUP58Q9BVL2 599 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 NOD2Q9HC29 1040 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1G2O95670 118 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 DNA2P51530 1060 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SLC8A3P57103 927 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 WTAPQ15007 396 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SLIT3O75094 1523 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 NID2Q14112 1375 aa23.54■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 THAP9Q9H5L6 903 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.53■■□□□ 1.36
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