RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 E4f1Q8CCE9 783 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nod2Q8K3Z0 1020 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dppa3Q8QZY3 150 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Bst2Q8R2Q8 172 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ces3bQ8VCU1 571 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kdm4bQ91VY5 1086 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcdhb15Q91Y04 786 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kctd10Q922M3 315 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Brms1Q99N20 246 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 LpxnQ99N69 386 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc5a5Q99PN0 618 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Iqca1Q9CUL5 857 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hmgn5Q9JL35 406 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Txnrd2Q9JLT4 524 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dctpp1Q9QY93 170 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Stxbp4Q9WV89 557 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sel1lQ9Z2G6 790 aa8.04□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CluhQ5SW19 1315 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem132bF7BAB2 1078 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Has3O08650 554 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hmx1O70218 332 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Magea8O89012 320 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 EporP14753 507 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kctd1Q5M956 257 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arhgef2Q60875 985 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Psen2Q61144 448 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Krt87Q6IMF0 495 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kctd3Q8BFX3 815 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cep85Q8BMK0 761 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fermt2Q8CIB5 680 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TMEM121BQ99MX7 572 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tomm22Q9CPQ3 142 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Filip1Q9CS72 1211 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Alpk1Q9CXB8 1231 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chd1lQ9CXF7 900 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Galntl5Q9D4M9 431 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Il21rQ9JHX3 529 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rcan3Q9JKK0 239 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hip1rQ9JKY5 1068 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Azi2Q9QYP6 405 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lypla2Q9WTL7 231 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Homer1Q9Z2Y3 366 aa8.03□□□□□ -1.12
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Scn3aA2ASI5 1947 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Clrn2B2RVW2 232 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cspp1B2RX88 1205 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vmn2r71L7N2D8 855 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CatspereP0DP43 985 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 L1camP11627 1260 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wnt7aP24383 349 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CebpaP53566 359 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 WasP70315 520 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Meis2P97367 477 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gjb4Q02738 266 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q3UJP5 209 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ankrd13cQ3UX43 541 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pnma5Q5DTT8 618 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kcnj11Q61743 390 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Garem2Q6PAJ3 880 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf653Q6YND2 615 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cep128Q8BI22 1102 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q8BZJ8 459 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pde5aQ8CG03 865 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 GlyctkQ8QZY2 523 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Krt34Q9D646 392 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plagl1Q9JLQ4 704 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prkab1Q9R078 270 aa8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Skint3A7TZF0 458 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zscan25B2RX31 543 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm5134E9QAB5 671 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 LipiF6YQT7 476 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nr1i2O54915 431 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fgl2P12804 432 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cxcl9P18340 126 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 EzrP26040 586 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Grin1P35438 938 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tdo2P48776 406 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mmp20P57748 482 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sap30bpQ02614 308 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2e1Q05421 493 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gas2l3Q3UWW6 683 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp13a3Q5XF89 1219 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sv2cQ69ZS6 727 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ift122Q6NWV3 1182 aa8.01□□□□□ -1.13
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mapk4Q6P5G0 583 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 83 ms