RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Timm44O35857 452 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klhl41A2AUC9 606 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AsphQ8BSY0 741 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arl8aQ8VEH3 186 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Acot10Q32MW3 439 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdc37Q61081 379 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 F13a1Q8BH61 732 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fermt3Q8K1B8 665 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 1700020D05RikQ99PB1 294 aa15.16■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mmrn1B2RPV6 1210 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm4297D3YWB7 211 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Myo1gQ5SUA5 1024 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ChukQ60680 745 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ano8Q6PB70 1060 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gimap5Q8BWF2 308 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nod2Q8K3Z0 1020 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Usp15Q8R5H1 981 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arhgef28P97433 1693 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AdgbG3UZ78 1657 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pnma5Q5DTT8 618 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prdm1Q60636 856 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pard3Q99NH2 1333 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Q66JV7 365 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CacybpQ9CXW3 229 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gstt4Q9D4P7 240 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc130Q9D516 385 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sorbs1Q62417 1290 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slain2Q8CI08 581 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdca7lQ922M5 438 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dach2Q925Q8 634 aa15.15■□□□□ 0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Card10P58660 1021 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cep126Q0VBV7 1103 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ripor2Q80U16 1078 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ankrd13cQ3UX43 541 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abtb2Q7TQI7 1024 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CntrobQ8CB62 887 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arhgap17Q3UIA2 846 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc14a2Q8R4T9 930 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tom1l1Q923U0 474 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnnc2P20801 160 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Map3k10Q66L42 940 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slf2Q6P9P0 1278 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rgs3Q9DC04 966 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rabgef1Q9JM13 491 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dip2aQ8BWT5 1523 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abcc12Q80WJ6 1366 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CemipQ8BI06 1361 aa15.14■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abca8aQ8K442 1620 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cnksr1A2A9K7 700 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MthfslL7N466 203 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Exoc5Q3TPX4 708 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 FibpQ9JI19 357 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CaluO35887 315 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SrprbP47758 269 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnf10Q3UIW5 804 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mtss1lQ6P9S0 715 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kcnj14Q8JZN3 434 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mmrn2A6H6E2 943 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 LdhaP06151 332 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cd22P35329 862 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GmncQ3URY2 333 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pla2g4fQ50L41 855 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Q6PD19 689 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gimap7Q8R379 293 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tex9Q9D845 387 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Clic4Q9QYB1 253 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CrklP47941 303 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Foxp1P58462 705 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Efcab2Q9CQ46 164 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arl2bpQ9D385 163 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ndufa13Q9ERS2 144 aa15.13■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Akap5D3YVF0 745 aa15.12■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Epc1Q8C9X6 813 aa15.12■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnajc17Q91WT4 303 aa15.12■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 EhhadhQ9DBM2 718 aa15.12■□□□□ 0.01
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kif9Q9WV04 790 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms