RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020077.10

Lims1-201, Transcript of LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lims1, Length 1,565 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1-201ENSMUST00000020077 Eid1Q9DCR4 169 aa11.78□□□□□ -0.52
Lims1-201ENSMUST00000020077 AllcQ9JHX6 414 aa11.78□□□□□ -0.52
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tfap4Q9JIZ5 338 aa11.78□□□□□ -0.52
Lims1-201ENSMUST00000020077 Prkab1Q9R078 270 aa11.78□□□□□ -0.52
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Lims1-201ENSMUST00000020077 Piezo1E2JF22 2547 aa11.77□□□□□ -0.52
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gm3138K7N754 218 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fgfr2P21803 821 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 CebpaP53566 359 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Nploc4P60670 608 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Esyt3Q5DTI8 891 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 MycbpapQ5SUV2 932 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kcnj14Q8JZN3 434 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Wasf1Q8R5H6 559 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Vta1Q9CR26 309 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Sbno2Q7TNB8 1349 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Col6a3E9PWQ3 3284 aa11.77□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Usp31E9Q6Y8 1344 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pfkfb3A7UAK5 555 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Nfil3O08750 462 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 AoahO35298 574 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 TxnP10639 105 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Dnm1P39053 867 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Samd11Q1RNF8 542 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kctd1Q5M956 257 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Zbtb7bQ64321 544 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Clca4aQ6Q473 924 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ssh1Q76I79 1042 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Prr11Q8BHE0 368 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Dpp9Q8BVG4 862 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 E4f1Q8CCE9 783 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Riox2Q8CD15 465 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Arhgef6Q8K4I3 771 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Slc18a1Q8R090 521 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Lzts2Q91YU6 671 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Inpp4aQ9EPW0 939 aa11.76□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rexo5D3YW29 759 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Copb2O55029 905 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Atp11aP98197 1187 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Slc27a1Q60714 646 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 MylipQ8BM54 445 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Etnk1Q9D4V0 363 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Psmd10Q9Z2X2 231 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gm5114W4VSN8 858 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Dock2Q8C3J5 1828 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Plcb2A3KGF7 1181 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ccng2O08918 344 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cyp3a25O09158 503 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 NcanP55066 1268 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fam89aQ14BJ1 175 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Wdr93Q402B2 695 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cyp2c29Q64458 490 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gmcl1Q920G9 524 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tfcp2Q9ERA0 502 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Scnn1bQ9WU38 638 aa11.75□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Nlrc5C3VPR6 1915 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Parp2O88554 559 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 StamP70297 548 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 HmgcrQ01237 887 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tff2Q03404 129 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tshz1Q5DTH5 1084 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Arhgef2Q60875 985 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Sp4Q62445 782 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 PhkbQ7TSH2 1085 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Dusp4Q8BFV3 398 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Prkag3Q8BGM7 489 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Armc6Q8BNU0 468 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kdm4aQ8BW72 1064 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Onecut3Q8K557 490 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Srgap1Q91Z69 1062 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rad9aQ9Z0F6 389 aa11.74□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Hoxc6P10629 235 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kcna1P16388 495 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gadd45bP22339 160 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cd22P35329 862 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 PRAG1Q571I4 1179 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ccdc178Q8CDV0 866 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Plcd1Q8R3B1 756 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Zcchc14Q8VIG0 956 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Homer1Q9Z2Y3 366 aa11.73□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 U2af2P26369 475 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 CgnP59242 1191 aa11.72□□□□□ -0.53
Lims1-201ENSMUST00000020077 Epha2Q03145 977 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms