RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W DAN4P47179 1161 aa11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W TGL2P54857 326 aa11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PHO5P00635 467 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SPT15P13393 240 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PHO84P25297 587 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RSC6P25632 483 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YKL100CP34248 587 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YPT52P36018 234 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W FRT2P39734 528 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SCS2P40075 244 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W LSM5P40089 93 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W TIS11P47977 285 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W MTO1P53070 669 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SHY1P53266 389 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GTR2P53290 341 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GTR1Q00582 310 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ARG7Q04728 441 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YDR338CQ05497 695 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YOL019WQ08157 551 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W MCD1Q12158 566 aa11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CAR1P00812 333 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CDC21P06785 304 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YAR066WP0CX18 203 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YHR214WP0CX19 203 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W POL30P15873 258 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YKL151CP36059 337 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HSE1P38753 452 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W REX2P54964 269 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YML131WQ03102 365 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HPF1Q05164 967 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W TRM8Q12009 286 aa10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RNA1P11745 407 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HOM2P13663 365 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RSR1P13856 272 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GUK1P15454 187 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RAD14P28519 371 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W MLS1P30952 554 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CCR4P31384 837 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ATP11P32453 318 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RPF2P36160 344 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HXT5P38695 592 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YJR154WP47181 346 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ART5P53244 586 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W NNF2P53253 936 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HST3P53687 447 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CWC24P53769 259 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SNO2P53823 222 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W BCH1Q05029 724 aa10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W UBR1P19812 1950 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PMR1P13586 950 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PDB1P32473 366 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SSE1P32589 693 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SPR1P32603 445 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RML2P32611 393 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SIP2P34164 415 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GIP1P38229 639 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W NPT1P39683 429 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YER034WP40022 185 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W COQ5P49017 307 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W USE1P53146 245 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YPL109CQ02981 657 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GAS3Q03655 524 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GTB1Q04924 702 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YLR049CQ12110 428 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ATG34Q12292 412 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PST1Q12355 444 aa10.97□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W TRP3P00937 484 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SWI5P08153 709 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SDH3P33421 198 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W TCD2P36101 447 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YHL008CP38750 627 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CCT6P39079 546 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ARB1P40024 610 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ZRG17P53735 605 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GRS2Q06817 618 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W ESA1Q08649 445 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W NAG1Q8TGN9 163 aa10.96□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W COS2P0CX12 379 aa10.95□□□□□ -0.66
RNQ1YCL028W COS3P0CX13 379 aa10.95□□□□□ -0.66
RNQ1YCL028W MET8P15807 274 aa10.95□□□□□ -0.66
RNQ1YCL028W VPS34P22543 875 aa10.95□□□□□ -0.66
RNQ1YCL028W GFD2P25370 566 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RNQ1YCL028W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RNQ1YCL028W COX13P32799 129 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.5 ms