RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF543Q08ER8 600 aa20.89■□□□□ 0.93
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CLN8-211ENST00000636934 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.86■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.86■□□□□ 0.93
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CLN8-211ENST00000636934 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 TMEM139Q8IV31 216 aa20.85■□□□□ 0.93
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CLN8-211ENST00000636934 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 PP2D1A8MPX8 630 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 RHOBTB3O94955 611 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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CLN8-211ENST00000636934 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-211ENST00000636934 ADSSL1Q8N142 457 aa20.84■□□□□ 0.93
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