RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC28Q96AY4 2481 aa32.7■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 GJA9P57773 515 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF365Q70YC5 407 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 HOMER2Q9NSB8 354 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST13Q8NET6 341 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 FEM1BQ9UK73 627 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM126BQ8IXS8 530 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 GSG1L2A8MUP6 293 aa32.66■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 TDO2P48775 406 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa32.66■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2C18P33260 490 aa32.65■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 GIMAP6Q6P9H5 292 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGFBP4P22692 258 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB30Q15771 203 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RASIP1Q5U651 963 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP32.64■■■□□ 2.82
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CAPNS1-217ENST00000629983 THEGQ9P2T0 379 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OAZ1P54368 228 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTN2Q02246 1040 aa32.63■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IL23AQ9NPF7 189 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa32.62■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLFN13Q68D06 897 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 APPBP2Q92624 585 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBP2Q969R2 916 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ACAD9Q9H845 621 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ECHDC1Q9NTX5 307 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR4Q9NYA4 1195 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL1O95922 423 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP3P12645 472 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL17Q6UXB2 119 aa32.61■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 HERVK_113Q902F9 699 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP4CQ96CF2 233 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 TLK2Q86UE8 772 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MKL1Q969V6 931 aa32.59■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 TSPY8P0CW00 308 aa32.58■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 ASB2Q96Q27 587 aa32.58■■■□□ 2.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa32.58■■■□□ 2.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 ASB14A6NK59 587 aa32.57■■■□□ 2.8
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CAPNS1-217ENST00000629983 FDX1P10109 184 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 STAT2P52630 851 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL23P55773 120 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRE1Q14246 886 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOP2Q7RTS6 562 aa32.57■■■□□ 2.8
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZEB2O60315 1214 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA7Q13683 1181 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM133AQ8N9E0 248 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 AGBL1Q96MI9 1066 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ASTN1O14525 1302 aa32.55■■■□□ 2.8
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