RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 CDC23Q9UJX2 597 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PQ27 194 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PQ64 194 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PQD8 194 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 BAG2O95816 211 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 ADD1P35611 737 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CPXCR1Q8N123 301 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 USP44Q9H0E7 712 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PTPRTO14522 1441 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 OPHN1O60890 802 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PPP6R2O75170 966 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 POLD1P28340 1107 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GRM1Q13255 1194 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TOM1O60784 492 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GUCY2DQ02846 1103 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 K7ENM7 598 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 DEPTORQ8TB45 409 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PCDHA12Q9UN75 941 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 IFNB1P01574 187 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CASP14P31944 242 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GCKP35557 465 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SLC35F6Q8N357 371 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TRPC6Q9Y210 931 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TTLL3Q9Y4R7 772 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 USP17L12C9JPN9 530 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 USP17L21D6R901 530 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CCT5P48643 541 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PRR16Q569H4 304 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 NXNQ6DKJ4 435 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TEKT1Q969V4 418 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 Q9H521 79 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TNKSO95271 1327 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PASKQ96RG2 1323 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 DMTNQ08495 405 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SETSIPP0DME0 302 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 RASSF7Q02833 373 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TCIRG1Q13488 830 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 NLRX1Q86UT6 975 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 VCX3AQ9NNX9 186 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 ADAM9Q13443 819 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 NSMFQ6X4W1 530 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GSDMBQ8TAX9 411 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 MAGEF1Q9HAY2 307 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GINS2Q9Y248 185 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 RBL2Q08999 1139 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 EFCC1Q9HA90 598 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 BTBD18B2RXH4 712 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 H2AFZP0C0S5 128 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 VPS41P49754 854 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 H2AFVQ71UI9 128 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 HAUS1Q96CS2 278 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CLTAP09496 248 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 RPS6KA2Q15349 733 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 HVCN1Q96D96 273 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PDE6AP16499 860 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CUL4BQ13620 913 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 USP40Q9NVE5 1235 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 FGAP02671 866 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 LIG4P49917 911 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SESN3P58005 492 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 PTGDRQ13258 359 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 DNAJC10Q8IXB1 793 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.08□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.08□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 TRIM50Q86XT4 487 aa13.08□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 SDR42E1Q8WUS8 393 aa13.08□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 HOOK2Q96ED9 719 aa13.08□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
TNS1-220ENST00000611415 CNGA1P29973 690 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-220ENST00000611415 EHHADHQ08426 723 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms