RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 LMNB2Q03252 620 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GRAPQ13588 217 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 JMYQ8N9B5 988 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 PHC3Q8NDX5 983 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 LINS1Q8NG48 757 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 NKD1Q969G9 470 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 VPS33BQ9H267 617 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 RRAGCQ9HB90 399 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CACNA1FO60840 1977 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SLX4Q8IY92 1834 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC12Q96J65 1359 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 THBS1P07996 1170 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GPC1P35052 558 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 APOBRQ0VD83 1088 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GRIN2CQ14957 1233 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 DDR2Q16832 855 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GNASQ5JWF2 1037 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 OLFM4Q6UX06 510 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 RELTQ969Z4 430 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP89Q96ST8 783 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 EREGO14944 169 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 EGFRP00533 1210 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 GCKRQ14397 625 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 BEND3Q5T5X7 828 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 FERMT3Q86UX7 667 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 JDP2Q8WYK2 163 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP44Q9C0F1 390 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 EHD4Q9H223 541 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC4O15439 1325 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SBF1O95248 1867 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 F6X3S4 739 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PEX14O75381 377 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH1L1O75891 902 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 EDN3P14138 238 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 EPB42P16452 691 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GIPRP48546 466 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 C1QTNF8P60827 252 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 UBP1Q9NZI7 540 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTN3Q9P232 1028 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ADCY9O60503 1353 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TOMM70O94826 608 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PF4P02776 101 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CSF1RP07333 972 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 LIG3P49916 1009 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SQSTM1Q13501 440 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TCEA2Q15560 299 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf27AQ580R0 203 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ODR4Q5SWX8 454 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms