RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SARM1Q6SZW1 724 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FANCBQ8NB91 859 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC18Q9H819 358 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCA1Q86XH1 822 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A6Q9BXS9 759 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TOMM22Q9NS69 142 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SRRDQ9UH36 339 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRFP10586 1907 aa29.16■■■□□ 2.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 CDC25BP30305 580 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SPP2Q13103 211 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PHKBQ93100 1093 aa29.15■■■□□ 2.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.268e-17■□□□□ 10.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 DDAH1O94760 285 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP1P03956 469 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 INCENPQ9NQS7 918 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 JAG1P78504 1218 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPAQ15257 358 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TREML2Q5T2D2 321 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIFA3Q9BQP9 254 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TNKSO95271 1327 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 BRCA2P51587 3418 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 USP17L5A8MUK1 530 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CUTAO60888 179 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCB1Q15051 598 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CTR9Q6PD62 1173 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K14Q99558 947 aa29.13■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.12■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 RXRAP19793 462 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP57L1Q8IYX8 460 aa29.11■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC25Q9H1X3 360 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 HPSEQ9Y251 543 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFA8P51970 172 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 AIFM3Q96NN9 605 aa29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 HMGCS2P54868 508 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FCGRTP55899 365 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 MYPNQ86TC9 1320 aa29.08■■■□□ 2.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GVL5 298 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF202O95125 648 aa29.07■■■□□ 2.24
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