RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBA7P41226 1012 aa18.63■□□□□ 0.57
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNJ12Q14500 433 aa18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DOK7Q18PE1 504 aa18.57■□□□□ 0.56
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R18Q6NYC8 613 aa18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNGA4Q8IV77 575 aa18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EHD4Q9H223 541 aa18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.567e-9■■□□□ 13.7
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADCY7P51828 1080 aa18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF543Q08ER8 600 aa18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.56■□□□□ 0.56
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