RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A27	O95847	323 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	GNRH1	P01148	92 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	ALAS1	P13196	640 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	OAZ1	P54368	228 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	PRKCZ	Q05513	592 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	HOMER1	Q86YM7	354 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K14	Q99558	947 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	BACH2	Q9BYV9	841 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	MROH8	Q9H579	483 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	COPB2	P35606	906 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RTN1	Q16799	776 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	SRRD	Q9UH36	339 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	GABRQ	Q9UN88	632 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	GNAQ	P50148	359 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	USH1G	Q495M9	461 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RAET1E	Q8TD07	263 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RIPK3	Q9Y572	518 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF536	O15090	1300 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	ATP2A1	O14983	1001 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	ICAM1	P05362	532 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	NEK4	P51957	841 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	FLT3LG	P49771	235 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF11	Q86T75	865 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	MMP19	Q99542	508 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	RNF146	Q9NTX7	359 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-223	ENST00000584229	PRMT2	P55345	433 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	FBXL16	Q8N461	479 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	IL17RA	Q96F46	866 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	FCER1A	P12319	257 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2B6	P20813	491 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRE	P23469	700 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	AK2	P54819	239 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	STK3	Q13188	491 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD2	Q14681	263 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	PIGS	Q96S52	555 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ACAD9	Q9H845	621 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD1	Q15327	319 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	CYTH3	O43739	400 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ADORA2A	P29274	412 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	RGS2	P41220	211 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	RCAN1	P53805	252 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	DPP9	Q86TI2	863 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	PNMA2	Q9UL42	364 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB5	O15062	677 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	STRN	O43815	780 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	MAP2K5	Q13163	448 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	GRB14	Q14449	540 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	CDC27	P30260	824 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	MORN1	Q5T089	497 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	DDX11	Q96FC9	970 aa		28.9	■■■□□ 2.22

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