RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TTC36A6NLP5 189 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 NLRX1Q86UT6 975 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM4Q9C037 500 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ATP7AQ04656 1500 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 H0YIN7 160 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SNCBQ16143 134 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 DEPTORQ8TB45 409 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PHBP35232 272 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 P4HA1P13674 534 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 IFNB1P01574 187 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 K7ENM7 598 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA2P54652 639 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R5EQ16537 467 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 FAM71BQ8TC56 605 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PTGDRQ13258 359 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GSDMBQ8TAX9 411 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.343e-9■■■□□ 19.2
PTPRM-211ENST00000580170 COBLO75128 1261 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT17Q6IS24 598 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2IP78347 998 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 KRT81Q14533 505 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 KLRF2D3W0D1 207 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 CASP14P31944 242 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PDE6CP51160 858 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM9Q13443 819 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ST7Q9NRC1 585 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQ27 194 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQ64 194 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQD8 194 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 VPS41P49754 854 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 STAM2O75886 525 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A2P55011 1212 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PRKG1Q13976 671 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 MAP4K1Q92918 833 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 HINFPQ9BQA5 517 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 MYOM2P54296 1465 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 MED4Q9NPJ6 270 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 OPHN1O60890 802 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PHKG2P15735 406 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 RASEFQ8IZ41 740 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 STAP2Q9UGK3 403 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 THAP12O43422 761 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 HOOK2Q96ED9 719 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 LIG4P49917 911 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 COG7P83436 770 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 MCTP2Q6DN12 878 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PPP6R2O75170 966 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PPP4R1Q8TF05 950 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TEKT1Q969V4 418 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TRPC6Q9Y210 931 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF7Q02833 373 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 LRRD1A4D1F6 860 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.37■■□□□ 1.33
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