RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, humanhuman

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1-208ENST00000576557 CNTN2Q02246 1040 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GNASQ5JWF2 1037 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MFSD5Q6N075 450 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 USP38Q8NB14 1042 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 APPBP2Q92624 585 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CEP95Q96GE4 821 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF576Q9H609 170 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 SPC25Q9HBM1 224 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 FEM1BQ9UK73 627 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ELP1O95163 1332 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 NCOR1O75376 2440 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 M0R2C6 588 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GPAA1O43292 621 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ACRP10323 421 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CSF2RAP15509 400 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 BEX3Q00994 111 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TMEM240Q5SV17 173 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 SLFN13Q68D06 897 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ARMCX2Q7L311 632 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PPM1EQ8WY54 764 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MKL1Q969V6 931 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TIFAQ96CG3 184 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 FBXO40Q9UH90 709 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CDH23Q9H251 3354 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 EYSQ5T1H1 3165 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ARVCFO00192 962 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 BMP3P12645 472 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PBX2P40425 430 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GJA9P57773 515 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.075e-8■□□□□ 10.9
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF365Q70YC5 407 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CHST13Q8NET6 341 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TMEM232C9JQI7 657 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TTLL1O95922 423 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 PTGS1P23219 599 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 CYP2C18P33260 490 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TMEM199Q8N511 208 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 PBX4Q9BYU1 374 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 CTAGE5O15320 804 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TSPY3P0CV98 308 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TSPY8P0CW00 308 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 GNAT2P19087 354 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 OAZ1P54368 228 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 SNAP25P60880 206 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TFAP4Q01664 338 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TNFAIP2Q03169 654 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 GPATCH3Q96I76 525 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 KATNBL1Q9H079 304 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 ACAD9Q9H845 621 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 RNF146Q9NTX7 359 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 ASTN1O14525 1302 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 MCCP23508 829 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 RASIP1Q5U651 963 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 CCDC174Q6PII3 467 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 CD4P01730 458 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 ALAS1P13196 640 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 SLC1A4P43007 532 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 STAT2P52630 851 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC1-208ENST00000576557 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms