RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASNS	P08243	561 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MCM7	P33993	719 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	INF2	Q27J81	1249 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GINM1	Q9NU53	330 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STX1A	Q16623	288 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ECE1	P42892	770 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPECC1	Q5M775	1068 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM232	C9JQI7	657 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LAD1	O00515	517 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ACER1	Q8TDN7	264 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CUL5	Q93034	780 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANO10	Q9NW15	660 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NEK8	Q86SG6	692 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CNNM3	Q8NE01	707 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HOOK2	Q96ED9	719 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VCPKMT	Q9H867	229 aa		33.14	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LONRF3	Q496Y0	759 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KANK3	Q6NY19	840 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AMN	Q9BXJ7	453 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STAT2	P52630	851 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DCAF15	Q66K64	600 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBCK	Q8TEA7	893 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PRPH	P41219	470 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRAF1	Q13077	416 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM260	Q9NX78	707 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PLA2G6	O60733	806 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF165	P49910	485 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LETM2	Q2VYF4	491 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FBXO11	Q86XK2	927 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	USP25	Q9UHP3	1055 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CBX8	Q9HC52	389 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MCTP2	Q6DN12	878 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	USP49	Q70CQ1	688 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EPSTI1	Q96J88	318 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IL17A	Q16552	155 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM160B2	Q86V87	743 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NEMF	O60524	1076 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NLRP12	P59046	1061 aa		33.05	■■■□□ 2.88

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