RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 PTPRAP18433 802 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 TTC38Q5R3I4 469 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.366e-7■■■■■ 32.1
CTU2-208ENST00000566637 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 AMNQ9BXJ7 453 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 FZD1Q9UP38 647 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 TRAF1Q13077 416 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 GSE1Q14687 1217 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 ADALQ6DHV7 355 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 FBXO11Q86XK2 927 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 ADAMTS3O15072 1205 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 MTMR2Q13614 643 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 CUL5Q93034 780 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 CDCA5Q96FF9 252 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 A0A1W2PQ27 194 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 A0A1W2PQ64 194 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 A0A1W2PQD8 194 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 MAP3K9P80192 1104 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 SPP2Q13103 211 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 KIFC2Q96AC6 838 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 LIG1P18858 919 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 SNAP25P60880 206 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 CSADQ9Y600 493 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-208ENST00000566637 POTECB2RU33 542 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 BACE1P56817 501 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 DLK2Q6UY11 383 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 FSIP1Q8NA03 581 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 CUTAO60888 179 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 C19orf81C9J6K1 198 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 ZNF174Q15697 407 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 OTOFQ9HC10 1997 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 VCAM1P19320 739 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 VGLL4Q14135 290 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 INF2Q27J81 1249 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 USH1GQ495M9 461 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 TMEM260Q9NX78 707 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 DACT1Q9NYF0 836 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 CMA1P23946 247 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 MCM7P33993 719 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 CCDC174Q6PII3 467 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 C12orf42Q96LP6 360 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 PTPREP23469 700 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 ZNF445P59923 1031 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 UBE2SQ16763 222 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 MCTP2Q6DN12 878 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 NEK8Q86SG6 692 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 WNT7AO00755 349 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 NR1I2O75469 434 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 FLOT1O75955 427 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 HMGCS2P54868 508 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-208ENST00000566637 DGKZQ13574 1117 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms