RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 WDR18Q9BV38 432 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 TRIM75PA6NK02 468 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 VGLL4Q14135 290 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 KIFC2Q96AC6 838 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 LIG1P18858 919 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 GNA11P29992 359 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 SLC39A14Q15043 492 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 BICD2Q8TD16 824 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 ADCY7P51828 1080 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 MOB2Q70IA6 237 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 LPAR1Q92633 364 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 TMEM260Q9NX78 707 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 VCAM1P19320 739 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 BACE1P56817 501 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 MAP3K9P80192 1104 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 USH1GQ495M9 461 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 FEM1BQ9UK73 627 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 FBXO11Q86XK2 927 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PARP14Q460N5 1801 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PLA2G6O60733 806 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 USP14P54578 494 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 UBE2SQ16763 222 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 TTC38Q5R3I4 469 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 FAM160B2Q86V87 743 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 AMNQ9BXJ7 453 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 NF2P35240 595 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 INF2Q27J81 1249 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CCDC174Q6PII3 467 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 RRAGCQ9HB90 399 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PTPRFP10586 1907 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PPP6R2O75170 966 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 HMGCS2P54868 508 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 ZNF174Q15697 407 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CSADQ9Y600 493 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.836e-7■□□□□ 10.3
HERC2-208ENST00000566635 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CUL5Q93034 780 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 TRAF5O00463 557 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 TRAPPC10P48553 1259 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 ADALQ6DHV7 355 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 FSIP1Q8NA03 581 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 ELP3Q9H9T3 547 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CLIC6Q96NY7 704 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC2-208ENST00000566635 NR1I2O75469 434 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 JMYQ8N9B5 988 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 FLOT1O75955 427 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 MCM7P33993 719 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 GRIN1Q05586 938 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 C12orf42Q96LP6 360 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 DACT1Q9NYF0 836 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 RLFQ13129 1914 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 A0A1W2PQ27 194 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 A0A1W2PQ64 194 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 A0A1W2PQD8 194 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC2-208ENST00000566635 USP17L15C9J2P7 530 aa20.19■□□□□ 0.82
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