RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 COG2Q14746 738 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PKN1Q16512 942 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 WASF1Q92558 559 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 DSG3P32926 999 aa22.15■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB5O15062 677 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SCG2P13521 617 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SNAP25P60880 206 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 AIFM3Q96NN9 605 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ALG1Q9BT22 464 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 MYPNQ86TC9 1320 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 BTBD19C9JJ37 291 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 OSBPP22059 807 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ATG4CQ96DT6 458 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 FDX1P10109 184 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 FOSBP53539 338 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PTPN18Q99952 460 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PNMA3Q9UL41 463 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PDHXO00330 501 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 VWA5AO00534 786 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 CA12O43570 354 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ZBED4O75132 1171 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PDCP20941 246 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 INHBEP58166 350 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 CCDC174Q6PII3 467 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 FBXO11Q86XK2 927 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 C8orf76Q96K31 380 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 MGAMO43451 1857 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 XBP1P17861 261 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SYT1P21579 422 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 HERVK_113P62684 666 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 SREBF2Q12772 1141 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 COA7Q96BR5 231 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 AMNQ9BXJ7 453 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 BARHL2Q9NY43 387 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 TRIM29Q14134 588 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 CPXCR1Q8N123 301 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 PLXNB2O15031 1838 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-204ENST00000564105 ZNF536O15090 1300 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 STXBP3O00186 592 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 DDIT3P35638 169 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 USH1GQ495M9 461 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 LBX2Q6XYB7 198 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 REPS2Q8NFH8 660 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 H3BQV1 296 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 ICAM1P05362 532 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 CYP2C8P10632 490 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 NAPAP54920 295 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 GUCY1B3Q02153 619 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 KRT40Q6A162 431 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 IFNL1Q8IU54 200 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 MB21D1Q8N884 522 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 SHISA4Q96DD7 197 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 STX6O43752 255 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 TM4SF4P48230 202 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 OAZ1P54368 228 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 TRAF1Q13077 416 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTU2-204ENST00000564105 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.06■■□□□ 1.12
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