RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563877.5

FAM219B-208, Transcript of family with sequence similarity 219 member B, human

TSL 2

Gene FAM219B, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM219B-208	ENST00000563877	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	RTP1	P59025	263 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	DCAF4	Q8WV16	495 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	ACAD9	Q9H845	621 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	PGK1	P00558	417 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	SNAP25	P60880	206 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	CCDC96	Q2M329	555 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	CCDC174	Q6PII3	467 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	RNF180	Q86T96	592 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	FERMT2	Q96AC1	680 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	FGD4	Q96M96	766 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	RNF146	Q9NTX7	359 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	LAMA3	Q16787	3333 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	HIP1	O00291	1037 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	TKFC	Q3LXA3	575 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	ZNF213	O14771	459 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	ALAS1	P13196	640 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	PHF24	Q9UPV7	400 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FAM219B-208	ENST00000563877	POTEB2	H3BUK9	544 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	CNTN2	Q02246	1040 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	ACVR2B	Q13705	512 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	TTC14	Q96N46	770 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	SLC16A2	P36021	539 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	SNX17	Q15036	470 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	TDH	Q8IZJ6	230 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	ESR2	Q92731	530 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		27.69	■■■□□ 2.02
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FAM219B-208	ENST00000563877	TRIM60	Q495X7	471 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	ARMCX2	Q7L311	632 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	NEDD4	P46934	1319 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
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FAM219B-208	ENST00000563877	ICAM1	P05362	532 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	PDE4A	P27815	886 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
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FAM219B-208	ENST00000563877	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		27.67	■■■□□ 2.02
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FAM219B-208	ENST00000563877	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877		A0A1W2PQY0	241 aa		27.65	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		27.65	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		27.65	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	KATNBL1	Q9H079	304 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
FAM219B-208	ENST00000563877	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		27.64	■■■□□ 2.02
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FAM219B-208	ENST00000563877	ADCY6	O43306	1168 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	NT5C2	P49902	561 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	ACLY	P53396	1101 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	ZNF543	Q08ER8	600 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	NSMF	Q6X4W1	530 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	MCM3AP	O60318	1980 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	KDM4A	O75164	1064 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	SNHG28	P0DPA3	235 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	TLE2	Q04725	743 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	KCNA10	Q16322	511 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	DGKH	Q86XP1	1220 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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