RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 UCN2Q96RP3 112 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 LGR6Q9HBX8 967 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 SWAP70Q9UH65 585 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC12Q96J65 1359 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 TRAF5O00463 557 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 IGFBP4P22692 258 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 MTHFSP49914 203 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 NARFQ9UHQ1 456 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-209ENST00000561136 TAF1P21675 1872 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 DBX1A6NMT0 343 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 AOC2O75106 756 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 PRNPP04156 253 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 F13BP05160 661 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 BDNFP23560 247 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 KCNB2Q92953 911 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SCYL1Q96KG9 808 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 POM121CA8CG34 1229 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HMOX1P09601 288 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 GYS2P54840 703 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 LDHDQ86WU2 507 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 TREML1Q86YW5 311 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 RASSF10A6NK89 507 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 H0YIN7 160 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 KCNQ3O43525 872 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 EPHA1P21709 976 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SCP2P22307 547 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SGO2Q562F6 1265 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 FDX2Q6P4F2 183 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 DLK2Q6UY11 383 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SHISA5Q8N114 240 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 FLCNQ8NFG4 579 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 NUP98P52948 1817 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 HTTP42858 3142 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 TLDC2A0PJX2 215 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 FAM177BA6PVY3 158 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CAMTA2O94983 1202 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 EPHX2P34913 555 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 IL13P35225 146 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SOX10P56693 466 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CNBD1Q8NA66 436 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 SPACA7Q96KW9 195 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 CAPNS2Q96L46 248 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-209ENST00000561136 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms