RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAT	P00750	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF2	P15336	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	GNA15	P30679	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF4	P78317	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	USP51	Q70EK9	711 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CYBB	P04839	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS13	O14921	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CDSN	Q15517	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF2C	Q99661	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF205	O95201	554 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	DBH	P09172	617 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	RLBP1	P12271	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAM1	P13591	858 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	GBP1	P32455	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	MVK	Q03426	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM221A	A4D161	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR3B	O95264	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	BPNT1	O95861	308 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP8B	P34820	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	NTM	Q9P121	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJA2	O60884	412 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	UBOX5	O94941	541 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSH	P09668	335 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS11	Q9H270	941 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	ASGR2	P07307	311 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	MC3R	P41968	323 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	DAB2	P98082	770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM1	P22735	817 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR5	P85299	388 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	LGI4	Q8N135	537 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69

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