RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 SIGLEC6O43699 453 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 OSBP2Q969R2 916 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC140Q96MF4 163 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 IER2Q9BTL4 223 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 KCNH1O95259 989 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FAM87AP0C7U9 286 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MAP4K2Q12851 820 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CD109Q6YHK3 1445 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 BRF1Q92994 677 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 LGR4Q9BXB1 951 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 RAPGEF3O95398 923 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 STAT3P40763 770 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GRIA2P42262 883 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 AMPD3Q01432 767 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 KCNQ2O43526 872 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 EFCAB14O75071 495 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 LEFTY1O75610 366 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CPP00450 1065 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 HOXC12P31275 282 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 SOX5P35711 763 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GFRA1P56159 465 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GABREP78334 506 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 AMPD2Q01433 879 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PPP2R5DQ14738 602 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ABCA8O94911 1581 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 DLX3O60479 287 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 RAB11FIP3O75154 756 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PRAMEF1O95521 474 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 SCG5P05408 212 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GSNP06396 782 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ITIH2P19823 946 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CNGA1P29973 690 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CYP27A1Q02318 531 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ZAR1Q86SH2 424 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 MFSD4AQ8N468 514 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 Q96M66 194 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CHST7Q9NS84 486 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 A0A087X0B3 334 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PDE8AO60658 829 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 LRRN2O75325 713 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CBX7O95931 251 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 POU4F1Q01851 419 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GATA6Q92908 595 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ADGRL1O94910 1474 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 EEA1Q15075 1411 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms