RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTNL9Q6UXG8 535 aa19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM160B2Q86V87 743 aa19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA32Q96LK8 384 aa19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNH4Q9UQ05 1017 aa19.8■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 DGKZQ13574 1117 aa19.79■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATL3Q6DD88 541 aa19.79■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 TYW1BQ6NUM6 668 aa19.79■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMCO2A6NFE2 343 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNAP25P60880 206 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 FSTL1Q12841 308 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 BLIDQ8IZY5 108 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIFC2Q96AC6 838 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTMR8Q96EF0 704 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP28Q96RU2 1077 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 C6orf50Q9HD87 102 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRR12Q9ULL5 1215 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPRFP10586 1907 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 WNK4Q96J92 1243 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNA11P29992 359 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNAPC2Q13487 334 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPY5RQ15761 445 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 GALNT17Q6IS24 598 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 FLOT1O75955 427 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 GADL1Q6ZQY3 521 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLF1Q9BQI6 1058 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMYND12Q9H0C1 365 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAK2O60296 914 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 GJA5P36382 358 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM87AQ8NBN3 555 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMNQ9BXJ7 453 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO28Q9NVF7 368 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLIC4Q9Y696 253 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L15C9J2P7 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L13C9JLJ4 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L11C9JVI0 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L18D6R9N7 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L22D6RA61 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L17D6RBQ6 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L19D6RCP7 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L20D6RJB6 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP2B1P20020 1258 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L24Q0WX57 530 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO11Q86XK2 927 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM88BA6NKF7 163 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS3O15072 1205 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTF2A2P52657 109 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 STK38Q15208 465 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 USH1GQ495M9 461 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 RILPL1Q5EBL4 403 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANO1Q5XXA6 986 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAGLBQ8NCG7 672 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 BICD2Q8TD16 824 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 RASGRP4Q8TDF6 673 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC285556D6RIA3 1793 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADCY7P51828 1080 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRYD7Q5W111 196 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC174Q6PII3 467 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFRSF25Q93038 417 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR3EQ9NVU0 708 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHA6Q9UN73 950 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESYT2A0FGR8 921 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM205CA6NFA0 338 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 CETPP11597 493 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167.5 ms