RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.22□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FBXO40Q9UH90 709 aa11.22□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FEM1BQ9UK73 627 aa11.22□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.22□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIPK3Q9Y572 518 aa11.22□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FDX1P10109 184 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC4A3P48751 1232 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TDO2P48775 406 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FPGSQ05932 587 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAAP100Q0VG06 881 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ACVR2BQ13705 512 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KCNA10Q16322 511 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CPXCR1Q8N123 301 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHST13Q8NET6 341 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIFC2Q96AC6 838 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.21□□□□□ -0.61
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ELP1O95163 1332 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MCM3APO60318 1980 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GPAA1O43292 621 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTLL1O95922 423 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 APPP05067 770 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OAZ1P54368 228 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD35Q8N283 1001 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP95Q96GE4 821 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DCTPP1Q9H773 170 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPC25Q9HBM1 224 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VCANP13611 3396 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.2□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TIMP1P01033 207 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EPHB4P54760 987 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PDE4BQ07343 736 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MMRN1Q13201 1228 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IFNL3Q8IZI9 196 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYLIPQ8WY64 445 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.19□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRDM1O75626 825 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ASGR1P07306 291 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSPY3P0CV98 308 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSPY8P0CW00 308 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BMP3P12645 472 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FOSL2P15408 326 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDK7P50613 346 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GJA9P57773 515 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLFN13Q68D06 897 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MFSD5Q6N075 450 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYADML2A6NDP7 307 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM232C9JQI7 657 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 M0R2C6 588 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARVCFO00192 962 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERC2O15083 957 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STAT2P52630 851 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NKX3-2P78367 333 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.622e-7■□□□□ 10.5
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNASQ5JWF2 1037 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC174Q6PII3 467 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARMCX2Q7L311 632 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM160B2Q86V87 743 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM199Q8N511 208 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FGD4Q96M96 766 aa11.17□□□□□ -0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ACAD9Q9H845 621 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms