RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FBXO11Q86XK2 927 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MORC4Q8TE76 937 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 BRF1Q92994 677 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 BORCS6Q96GS4 357 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM87BQ96K49 555 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZIC5Q96T25 663 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RNF146Q9NTX7 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NYAP2Q9P242 653 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MYH3P11055 1940 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SLC25A27O95847 323 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FDX1P10109 184 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RASA1P20936 1047 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SHMT1P34896 483 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ERICH4A6NGS2 130 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 KLRF2D3W0D1 207 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GRK4P32298 578 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SOX10P56693 466 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP5P59047 1200 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SNAP25P60880 206 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DCAF4Q8WV16 495 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TEPSINQ96N21 525 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 WDR18Q9BV38 432 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 KBTBD13C9JR72 458 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 E7EWF7 191 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 UQCRHP07919 91 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FLT3LGP49771 235 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ACAD9Q9H845 621 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 INCENPQ9NQS7 918 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NMT2O60551 498 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MCM4P33991 863 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PRMT2P55345 433 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ERVK-9P63128 1117 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ERVK-24P63145 666 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TTC14Q96N46 770 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SCLT1Q96NL6 688 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MYL10Q9BUA6 226 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF3Q9H094 633 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PPFIA3O75145 1194 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 KIF20AO95235 890 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ERCC3P19447 782 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ALX1Q15699 326 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TREML2Q5T2D2 321 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 WASF1Q92558 559 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 AMNQ9BXJ7 453 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SLC27A2O14975 620 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZEB2O60315 1214 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PTH1RQ03431 593 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K11Q16584 847 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MROH8Q9H579 483 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TMX2Q9Y320 296 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SAMM50Q9Y512 469 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SPEF2Q9C093 1822 aa6.3□□□□□ -1.4
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