RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KCNK12Q9HB15 430 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 EVC2Q86UK5 1308 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 INSRP06213 1382 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 IFT172Q9UG01 1749 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KIF1BO60333 1816 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 WASH4PA8MWX3 477 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ESR1P03372 595 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 C1QTNF9P0C862 333 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TCF3P15923 654 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ZNF76P36508 570 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 FANCCQ00597 558 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 MAP3K11Q16584 847 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TOX2Q96NM4 488 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 PRAM1Q96QH2 718 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 DIRC2Q96SL1 478 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 NUDCQ9Y266 331 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TSPOAP1O95153 1857 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 F6X3S4 739 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 PGRP06401 933 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KIR3DL1P43629 444 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TTC6Q86TZ1 520 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 RNF34Q969K3 372 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 Q96M66 194 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TNRQ92752 1358 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 PPLO60437 1756 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 CYP7A1P22680 504 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 LIG3P49916 1009 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ERVFC1P60507 584 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TMEM87BQ96K49 555 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 CDK19Q9BWU1 502 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 POGKQ9P215 609 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 GGT7Q9UJ14 662 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ABCC11Q96J66 1382 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 PTPRMP28827 1452 aa7.15□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.15□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 LMNB1P20700 586 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 LTKP29376 864 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ABHD4Q8TB40 342 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CCDC120Q96HB5 630 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 COPRSQ9NQ92 184 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ALKQ9UM73 1620 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 METP08581 1390 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A19Q695T7 634 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MORC1Q86VD1 984 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 HK2P52789 917 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CREG2Q8IUH2 290 aa7.12□□□□□ -1.27
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